新疆维吾尔自治区水土保持生态环境监测总站机构规格相当（处）级，主要负责以下工作：

承担全区水土保持监测网络建设管理及水土保持水土监测工作：承担自治区内水土流失调查及水土保持公告发布工作：协助做好水土保持监督执法、项目评估验收等工作：承担水土保持科学技术研究、推广及人才培养工作。

内设机构

新疆维吾尔自治区水土保持生态环境监测总站内设5个科室，机构规格相当乡(科)级。

（一）总工办：列编制5名，领导职数2名。

负责总站（中心）技术管理工作；承担水土保持水土环境监测规划编制和计划落实工作；组织实施对全疆监测成果的鉴定、审核及质量认证等工作。

（二）综合科：列编制5名，领导职数2名。

负责组织专项水土流失防治和治理工作；负责水土保持科技示范园管理工作；承担文秘、人事管理、党建、精神文明、计划生育、安全生产管理、综合治理、工会、后勤工作、财务、固定资产管理工作。

（三）监测科：列编制7名，领导职数2名。

负责全疆水土保持监测工作；组织开展水土流失动态监测，负责水土保持生态环境监测规划和监测年报的编制等工作；指导地州监测分站开展动态监测工作。

（四）信息科：列编制5名，领导职数2名。

负责总站水土保持信息化规划的编制；负责全疆水土保持水土环境监测信息网络建设、管理和监测网络数据库的更新维护等工作；负责编制水土保持公告；承担全疆范围内的遥感监测工作。

（五）技术推广科：列编制5名，领导职数2名

负责全疆水土保持技术推广、水土流失预防治理和承担水土保持先进设备、技术的引进和推广工作；负责制定新疆水土保持监测技术标准、编制全疆水土保持技术推广计划并组织实施；指导培训监测技术人员；开展水土保持科学技术试验研究；承担水土保持方案技术审查及监测成果评审工作。