新疆维吾尔自治区水利厅位于乌鲁木齐市黑龙江路146号，是新疆维吾尔自治区人民政府的职能部门,是新疆维吾尔自治区水行政主管部门，担负着拟定自治区水行政的政策法规、发展战略和中长期规划，并依法监督实施；统一管理水资源（含空中水、地表水、地下水）；拟定节约用水政策，编制节约用水规划，制定有关标准，组织、指导和监督节约用水工作；组织拟定自治区水长期供求计划、水量分配方案并监督实施；组织、指导水政监察和水行政执法；协调并仲裁自治区境内水事纠纷；编制、审查大中型水利、水电、水产基建项目建议书和可行性报告及初步设计；组织、指导水利设施、水域及其岸线的管理与保护；组织全区河流、湖库的治理与开发；组织建设和管理具有控制性的或跨地区的重要水利工程；指导农村水利水土保持工作；组织协调农田水利基本建设、农村水电电气化县建设和乡镇供水工作；组织自治区水土保持工作；承担自治区防汛抗旱总指挥部的日常工作，组织、协调、监督、指导自治区防汛抗旱工作，对重要河湖及水利工程实施防洪抗旱调度。
